Цифровая патоморфология: анализ гистологических препаратов

Патоморфолог — самый дефицитный специалист онкологической службы: в регионах России и СНГ на одного врача приходятся тысячи препаратов в год. Цифровые сканеры решают вопрос логистики стекла, но не нагрузки: один скан WSI занимает 1–4 ГБ и содержит миллиарды пикселей, которые нужно просмотреть при большом увеличении.

Задачи, где ИИ уже показал результат, — поиск метастазов в лимфоузлах, подсчёт митозов, оценка экспрессии маркеров (Ki-67, HER2), предварительная сортировка биопсий. Но модели для гистологии обучаются на собственных данных лаборатории с учётом её окраски и сканера, а обучение на гигапиксельных изображениях — тяжёлая GPU-нагрузка.

Сканы разбиваются на тайлы, на которых работают свёрточные сети и фундаментальные модели патологии (UNI, CONCH и аналоги). Результаты собираются в тепловые карты поверх препарата в просмотрщике врача, а количественные показатели попадают в протокол.

• Дообучение открытых моделей на архиве лаборатории с валидацией по протоколу.
• Автоматический подсчёт клеток и оценка маркеров с воспроизводимостью выше ручной.
• Приоритизация препаратов: подозрительные попадают в очередь первыми.
• Интеграция с ЛИС и системой хранения сканов.

Важно: MIARCH поставляет вычислительную инфраструктуру и помогает развернуть модели. Само ПО для постановки диагноза является медицинским изделием и проходит регистрацию отдельно — на стороне разработчика или клиники.

Какие данные нужны

• Архив WSI-сканов с заключениями
• Разметка патологов по выбранным задачам
• Данные ЛИС и иммуногистохимии